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公元1402年6月13日，燕王朱棣经过四年的不懈努力，终于取得了靖难之役的胜利，被南京最大的内奸李景隆迎接进城。据说朱棣在率领大军进入南京城以后，并没有马上攻打皇宫。咱们先不说他内心想不想杀这建文帝，但表面上看，他还是想和大侄子谈谈，让大侄子把那些鼓动他鲁莽削藩、挑拨他们叔侄关系的大臣都交出来，把这些人收拾了以后，朱棣照样回北平城当藩王去。本来想的挺好，突然南京皇宫着起了大火，朱棣赶紧下令救火，但是已经晚了，皇宫被烧成了废墟，建文帝朱允文也不知死活。从此以后，大侄子去哪儿了，就成了朱棣心中一块永远放不下的石头。下面我把建文帝的几个广为流传的结局跟大家分享一下。
明太宗实录记载，燕王朱棣攻入南京城以后，马上派人去寻找建文帝，他要当面跟大侄子说清楚自己为什么要起兵，而且在铲除齐皇乱党以后，还要尽心竭力的辅佐朱允文。但没想到将士们把烧成废墟的南京皇宫翻了个遍，也没有找到皇上。正在一筹莫展之际，一个太监从皇宫里掏出了一具烧焦了的尸体，燕王殿下，这个人就是建文皇帝，他听说您打进了南京城，很害怕，所以自焚了。朱棣听说这个消息，犹如五雷轰顶啊，趴在建文帝尸体上放声痛哭，一边哭一边说，万岁呀，我只是想来帮你做个好皇帝，你又何必如此呢?但人死不能复生了，朱棣只能把建文帝安葬了。这种说法可信度很低，就凭一点，如果当时朱棣把建文帝安葬了，现在至少应该知道他埋在哪儿了，而不是至今都下落不明。
另外清初谷应泰的明史纪事本末里有这样一个故事，说朱棣攻破南京城的时候，建文帝知道大势已去，又不想跟四叔妥协，所以就带着后妃们准备自焚。这时候一个老太监赶紧过来说，万岁，您先别冲动，太祖皇帝给您留下了一个函匣，说让您在危难时刻把它打开。朱允文赶紧让太监把盒子打开了，里边放着剃刀、十锭白银、三张度牒、三套袈裟和一张字条。字条的大意就是如果朱允文遇到危险无力抵抗，可以按照纸上的路线逃跑到指定地点去当和尚。于是朱允文按照爷爷的指示，一边在皇宫中放火制造混乱，一边化装成和尚，带着两个随从趁乱逃出了南京。出城以后，在水边遇到一个驾船的道士，说是昨天晚上太祖皇帝给他托梦了，让他来接朱允文的。从此以后，朱允文为了躲避朱棣安排的特务，在西南地区和东南沿海一带很多寺庙都当过和尚。
他的逃亡生涯一共三十九年，把朱棣祖孙三代都熬死了以后，就到官府去说明了自己的身份。朱棣的重孙子明英宗朱祁镇在证实了他的身份以后，就把他接到了西苑居住，死后安葬在北京的西山。但这部明史纪事本末可信度也不是很高，它就有点像现在的小说一样，里边的很多历史人物在明朝都没有出现过。再有，西山也并没有明确埋葬朱允文的地点。第三种说法是，在朱棣被迎进南京金川门时，皇宫里只剩下朱允文一个人了，他决定留下来和朱棣顽抗到底。一个太监告诉他，宫里有一条可以通到城外的秘密通道，皇上不要在南京城等死了，先逃命，再找机会报仇，于是建文帝就从秘密通道出城，然后辗转到了福建，坐着海船去了国外，地点大约是现在印尼的苏门答腊岛。大家都知道明朝永乐年间，朱棣派郑和六下西洋，对外宣称是增进与外国的贸易友好往来，其实最重要的一个目的就是派郑和去找朱允文了。
也有人说，朱棣刚进南京城就抓到了朱允文，把他秘密处决了。之所以明目张胆的让郑和下西洋寻找朱允文，最重要的原因就是要制造他并没有杀害朱允文，而是他自己已经逃跑的假象。最后在清朝编修的明史中记载，用了五年，朱棣派胡滢带着御制的诏书去寻访张三丰，实际上就是去找朱允文了。九年以后，胡滢第一次返回京城，只待了半个月，就被朱棣催着赶紧启程了，连他母亲去世了，想守孝，朱棣都没批准。又过了七年，永乐二十一年，胡滢风风火火的到宣府找到正在带兵出征的朱棣，两个人谈了四个小时，具体谈话内容史书没有记载，谈完之后，朱棣就再也没有调查过建文帝的下落。很可能找到了朱允文，要么死了，要么隐居，不会对朱棣造成任何威胁了。
其实说了这么多种可能，我们还是不能肯定朱允文到底去哪儿了。我来说一下我个人的观点，我觉得朱允文很有可能被朱棣杀掉了。首先，朱棣虽然没在南京城，但是他收买了很多宫中的太监，可以说对皇宫里发生的事情了如指掌，那些太监在南京城被攻陷之后，一定会密切关注建文帝的行踪。朱允文想要神不知鬼不觉地逃跑，难度是很大的。另外，朱棣打了四年仗是因为什么呀?想当皇上，他想当皇上。齐泰、黄子澄、方孝孺、铁铉，这些人的死活都不重要，但有一个人必须死，就是大侄子朱允坤，如果他不死，朱棣就是篡位夺权。根据朱棣一贯的做事风格推断，他是一定会杀掉建文帝的。所以我觉得朱允文的下落之谜，只是朱棣为了隐瞒真相制造的流言蜚语罢了。
