继位后，皇太极顺应历史发展趋势，促进了后金政权的封建化进程。他派人丈量土地，将“各处余地”归公，发给民户耕种，不许旗主、贵族再立庄田。又把原来每13名壮丁编为一庄改为每8名壮丁编为一庄，“其余汉人，分屯别居，编为民户。”并下令编审壮丁，解放部分奴婢为编民。这些措施，使满族贵族的特权受到一定制约，有利于发展农业生产。他极力学习汉族文化，命儒臣翻译汉字书籍。
1632年(天聪六年)农历正月，废除“与三大贝勒，俱南面坐”，共理朝政的旧制，改为自己“南面独坐”，突出汗位独尊地位。继而寻机削除异已，铲除了威胁汗位的三大贝勒势力，使汗权得到巩固。仿明制，设内三院，六部，“停王贝勒领部院事”，独主政务。又设都察院和理藩院，建立起一套较为完备的国家机构。集中了汗权，加强了专制统治。
为了扩大兵源，创立了汉军八旗和蒙古八旗。命人在老满文的基础上增加圈点，将老满文改造成新满文。为了联络蒙古和西藏，大力扶植和宣扬喇嘛教。
他决意承袭父志，入主中原取代明朝统治。在即位后“邦家未固”时，一方面对明廷采取议和策略，同时又屡次入关，掳掠汉地大批人畜、财物。
为解除后顾之忧，两次出兵朝鲜，统一蒙古和黑龙江流域。在巩固了内部统治，并基本上消除了来自朝鲜和内蒙的威胁后，于1636年(天聪十年)农历五月，称帝，定国号“大清”，改元崇德，改族名女真为满洲。其后将主要兵力用于对明战争。[6]
1640年(崇德五年)七月，带病急援松锦之战，指挥清军取得松锦大捷，生擒洪承畴，歼灭明军五万余人。在降服松山、锦州后，清军占领了除宁远外的明朝关外全部城镇。
1642年(崇德七年)，再次遣军入关，连破远至山东的八十余城。
