同治十一年(1872)九月，同治举行大婚典礼，迎娶场面盛况空前。在新婚之夜，据说同治还对这位状元之女进行了一番文学上的考察，阿鲁特氏出口成章，对唐诗能够背诵如流，令他愈加爱慕敬重。
阿鲁特氏比同治年长，她以女性特有的温柔和母性呵护着皇帝，在她的熏染下，同治收敛了孩子般的任性，逐渐变得成熟稳重。
两人新婚燕尔，恩爱非常，招来了慈禧太后的不满。慈禧对同治立阿鲁特氏为后早已耿耿于怀，为了给皇后下马威，她故意抬高凤秀之女富察氏的地位，在册封妃嫔时，富察氏被封为慧妃，是品级最高的。按照惯例，妃嫔的册封礼与皇后的册立礼同日举行。但在同治大婚之日，只有慧妃的册封礼同日举行，瑜嫔、珣嫔的册封礼被安排到1个月以后。
现在看到同治与皇后缠绵厮守，恩恩爱爱，对她喜欢的慧妃却不理不睬，守寡多年的慈禧不免生出了几分妒意和恼意。她派太监监视皇帝皇后的行为举止，并对同治下谕：“慧妃贤惠，虽屈居妃位，宜加眷遇。皇后年少，未娴宫中礼节，宜使时时学习。帝毋得辄至中宫，致妨政务。”
这话说得蛮横无理，直截了当地说皇帝常到中宫，便是妨碍了政务，简直是强行将同治从阿鲁特氏身边拉走。同治不敢违抗太后懿旨，却也不愿违背意愿去亲近他不喜欢的慧妃，于是干脆独居乾清宫。
阿鲁特氏独守空房，对于婆婆的强横，她委曲求全，常常半夜垂泪至天明，但表面上绝不流露出半点不满，对慈禧太后仍是恭敬。但是慈禧对她的反感却丝毫无减，这主要也与阿鲁特氏的性格有关。
阿鲁特氏为人不苟言笑，也不善逢迎。她深受礼教熏陶，端庄正派，有意无意衬托出慈禧的低俗。有一次，阿鲁特氏陪同慈禧看戏，当台上演到男欢女爱时，慈禧看得津津有味，她却转头面壁，不愿观看，慈禧劝了多次，阿鲁特氏也不愿回头，这让慈禧非常难堪，对她愈加厌恶。
阿鲁特氏身边的人劝她要讨慈禧欢心，处理好与慈禧的关系，她却认为对长辈尊敬即可，用不着对慈禧阿谀奉承。亲人对她的处境感到忧心忡忡，阿鲁特氏安慰道，她奉天地祖宗之命，由大清门迎入，地位不是轻易可动摇的。清制规定，皇帝大婚时，只有皇后的凤舆才能经过大清门、午门、太和门到坤宁宫“降舆”，其他宫妃只能由神武门进宫。
探听到皇后此言的太监加油添醋回报给了慈禧，这可惹恼了她。慈禧通过选秀女入宫，从低品级的贵人一步步攀上了权力顶峰，她最大的遗憾是没能从大清门风风光光地入宫。
阿鲁特氏的话让慈禧想起了初入宫的低微身份，她咬牙切齿，认为阿鲁特氏故意轻视自己，从此有了将阿鲁特氏置于死地的念头。
